技术原理

       Label Free定量蛋白质组学技术是一种不依赖来同位素标记的技术,只需要大规模鉴定蛋白质组所产生的质谱,从而通过不同样品中相应肽段的信号强度完成定量分析。
其定量原理分两种:
1. 基于肽段峰强度(peak intensity)和峰面积(peak area)与蛋白丰度的关系
2. 基于肽段二级质谱数(Spectra counting)与蛋白丰度的关系

技术优势

1. 实验周期短,试剂成本耗费较低
2. 对样本的操作少,从而使其接近最原始的状态
3. 不受样品数量的限制,可同时平行比较大量样品间的蛋白质组差异

 

实验流程

参考文献

[1] Chandra K. Singh, Satwinderjeet Kaur, Nihal Ahmad, et al. Mechanism of anti-proliferative effects of sanguinarine in pancreatic cancer cells: A label-free quantitative proteomics approach. Cancer Research 2014, 74:4533-4533
[2] Enzo Scifo, Agnieszka Szwajda, Maciej Lalowski, et al. Drafting the CLN3 protein interactome in SH-SY5Y human neuroblastoma cells: a label-free quantitative proteomics approach. J Proteome Res. 2013, 12(5):2101-2115
[3] Xu D, Suenaga N, Kessler BM, et al. Novel MMP-9 substrates in cancer cells revealed by a label-free quantitative proteomics approach. Mol Cell Proteomics 2008, 7(11):2215-2228