SILAC定量蛋白质组

产品原理

         SILAC(Stable Isotope Labeling with Amino acids in Cell culture) 体内稳定同位素标记技术是一种有效的、稳定的针对细胞系蛋白质组定量变化的解决方案。 通过采用天然同位素(轻型)或稳定同位素(重型)标记取代培养基中的必需氨基酸(通常为Lys和Arg),细胞经>6个倍增周期后,稳定同位素标记氨基酸完全取代细胞新合成的蛋白质的相应氨基酸。不同标记的裂解蛋白按细胞数或蛋白量等量混合,经裂解、组分分离后进行质谱鉴定。

实验流程

                                                         

技术优势

       1.平行性好,消除了样品制备、质谱检测等各阶段可能引入的定量误差
       2.标记效果稳定,且标记效率>98%
       3.通过HPLC组分分离的方法,鉴定通量>8000

参考文献

       1.Georg Kustatscher, Nadia Hégarat, Juri Rappsilber and et al. Proteomics of a fuzzy organelle: interphase chromatin. EMBO Journal. 2014, 33, 648–664
       2.Phyllis SY Chong, Jianbiao Zhou, Wee Joo Chng, et al. LEO1 is regulated by PRL-3 and mediates its oncogenic properties in Acute Myeloid Leukemia. Cancer Research. 2014, 74
       3.Munday DC, Emmott E, Hiscox JA and et al. Quantitative proteomic analysis of A549 cells infected with human respiratory syncytial virus. Mol Cell Proteomics. 2010, 9(11):2438-2459

iTraq定量蛋白质组

技术原理

         该技术于2004年在美国质谱年会被首次提出,现已成为一种广泛应用的蛋白质组学定量技术。iTraq(isobaric tags for relative and absolute quantitation)通过8种同位素的标签,特异性的标记肽段的氨基基团,分别产生113、114、115、116、117、118、119和121的报告离子,在二级质谱中得到不同样品间蛋白质组的相对定量信息。

                                                         

实验流程

                                                         

技术优势

        1. 可同时比较8种样品间的蛋白质组差异变化
        2. 实验处理简单,周期短
        3. 牟合生物已完成中国、法国、德国、美国、南非等大量病理组织、临床病原微生物的定量蛋白质组学分析
        4. 基于系统生物学和精准医学的理念,率先提出了转录组学和蛋白质组学的关联分析,进一步提高组学数据的分析价值

                                                         

参考文献

         [1] Michael P. Weekers, Peter Tomasec, Steven P. Gygi and et al. Quantitative Temporal Viromics: An approach to investigate host-pathogen interaction. Cell. 2014, 157, 1460-1472
         [2] S Tonack, C Jenkinson, E Costello, et al. iTRAQ reveals candidate pancreatic cancer serum biomarkers: influence of obstructive jaundice on their performance. British journal of cancer. 2013, 108(9):1846-1853
         [3] Suvi-Katri Leivonen, Anne Rokka, Merja Perälä and et al. Identification of miR-193b targets in breast cancer cell and systems biological analysis of their functional impact. Mol Cell Proteomics. 2011, 10(7):3060-3075