近日，陈玲玲教授生物信息学团队携手徐强教授课题组于Mol Plant上发表了题为“Citrus Pan-genome to Breeding Database (CPBD): A comprehensive genome database for citrus breeding”的文章，正式推出柑橘泛基因组育种数据库——CPBD数据库（http://citrus.hzau.edu.cn/）。该数据库整合了柑橘属下多个物种的基因组、转录组、变异组和表观组信息，联合在线工具，助力柑橘育种研究。
因无性繁殖、世代时间长等对柑橘遗传和传统育种造成阻碍，加之柑橘专属数据库稀少，在以往发布的柑橘基因组草案和CAP (Citrus sinensis Annotation Project)数据库的基础上，提出构建全面的CPBD数据库。 CPBD数据库涵盖了迄今为止最新和最全面的柑橘类园艺植物基因组和转录组信息。CPBD数据库囊括了17个柑橘物种的23个基因组数据（已发表11个），13个园艺作物的4038套转录组数据，167份柑橘种质资源的变异组数据（2个参考基因组），44份样品DNA甲基化组数据（3个参考基因组），附23个基因组的直系同源基因、共线基因及基因功能/通路注释等信息，开发并引入序列提取、基因检索、BLAST、CRISPR 设计、GO /KEGG富集等实用工具，为柑橘育种科学研究带来极大的便利。    
CPBD数据库在每个模块中，提供了不同的搜索方法，用户可以从多个样本中获得一个基因的基因表达谱，也可以从一个样本中获得多个基因的基因表达谱。查找直系同源基因时，Gene ID Convert只提供每个基因组中最相似的基因，方便不同基因组间的基因比较；进行基因组变异查找时，输入基因ID或基因组区域，一键添加子类群，方便快捷；引入的CRISPR 设计和全基因组关联分析（GWAS）模块使得CPBD数据库成为一个强大的柑橘育种平台。此外，数据库提供表格下载、一键复制等用户友好型插件，提升了用户使用体验感。CPBD数据库是一个兼具全面、专业、高效及用户友好的数据库，我们期待更多优秀的数据库出现，助力育种，助力科研。

参考文献：
Liu H, Wang X, Liu S, Huang Y, Guo YX, Xie WZ, Liu H, Tahir Ul Qamar M, Xu Q, Chen LL. Citrus Pan-Genome to Breeding Database (CPBD): A comprehensive genome database for citrus breeding. Mol Plant. 2022 Oct 3;15(10):1503-1505.