cfDNA和蛋白标志物的液体活检技术应用于肝癌筛查

日期:2019-03-18 09:49

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       ctDNA液体活检技术自诞生之日起,便肩负着肿瘤早筛早诊的使命,无奈受制于复杂的肿瘤发生发展机制,不明确的ctDNA释放和代谢规律,以及对ctDNA检测技术性能的超高要求,这条战胜肿瘤的必经之路荆棘密布,即便如含着金钥匙出生的明星公司GRAIL,在该领域精耕细作数年,结果也是不温不火,差强人意。本周二发表于《美国科学院院刊》(PNAS)的一项最新研究成果在肝癌早筛领域取得新的进展,本研究基于细胞游离DNA(cfDNA)和蛋白标志物的液体活检技术,建立的HCC screen(the hepatocellular carcinom screen)方法在HBV携带者前瞻性队列中取得了良好的肝癌早筛结果。

研究内容


      研究人员首先利用包含有65例肝细胞癌和70例非肝癌的训练集队列数据,建立了区分肝癌和非肝癌的分类器模型,即HCCscreen 方法(the hepatocellular carcinoma screen),值得注意的是训练集队列为甲胎蛋白/B超阳性与疑似阳性的HBV携带者。 而该方法在验证集队列,即331例甲胎蛋白/B超阴性的HBV携带者中,早筛结果为:灵敏度100%,特异性94%,阳性预测值17%,在6-8个月的随访中发现了4例早期肝癌患者。
       即便如此高的灵敏度和特异性,我们看到阳性预测值也仅有17%,也就是说,如果不幸被该方法诊断出阳性,那么确诊为肝癌的概率也只有17%。可见在肿瘤早筛领域,对方法学的性能有着极高的要求。这也是肿瘤早筛技术能否从科研走向临床的关键指标。
 
研究亮点

      在2018年2月的《科学》(science)上,也发表了一项癌症早筛研究成果,即CancerSEEK方法,同样基于细胞游离DNA(cfDNA)和蛋白标志物的液体活检技术,同样用逻辑回归建模,同样精准的ctDNA检测技术,因此可以说《科学》这项研究是本研究的向导和先行者,它涵盖了8个癌种,其中最有效的5个癌种的灵敏度在69%-98%不等,特异性在99%以上,具体结果见图1,其中肝癌在95%左右。但这是一项回顾性研究,具体到单个癌种,样本量也显得过少。

      通过与前文的对比,

(1)这是一项规模较大的前瞻性队列研究,以此作为生物标志物的证据等级更高,更有临床应用价值。

(2)本研究结果基于甲胎蛋白/B超正常的HBV感染者群体,研究表明约40%早期肝癌患者AFP水平是正常的,可知这个高危群体数量庞大,但一直以来缺乏有效的早诊方法,本研究填补了这方面技术空白,更具群体针对性。

(3)在模型建立上,本研究利用高风险群体做非癌症队列的数据基线,高风险非癌症个体在算法的建立和阈值的确定方面起极重要的作用,这也是该方法性能优良的关键所在,更具实际应用性。