病毒侵染宿主的动态分析在QTV蛋白组定量中实现

日期:2017-10-30 16:25

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       QTV(quantitative temporal viromics)定量瞬时病毒组是一种基于质谱的蛋白质组学优化技术。哈佛大学医学院的Steven Gigy团队讲质谱技术的优点在这一技术上发挥的淋漓尽致,通过这一技术能够在病毒感染的过程中,对宿主和病毒蛋白的实时动态进行系统性定量分析,展现病毒与宿主的具体互作过程。

收集刚受到 CMV(巨细胞病毒)感染的胎儿包皮纤维原细胞,并在三天内的不同 时间点收获病毒和细胞的蛋白,用 8 标和 10 标的 TMT 结合质谱技术,定量细胞质膜和细 胞内的蛋白变化。一共鉴定到了 8000 多个蛋白,包括 1200 个细胞表面蛋白,有效感染过程 8 个时间点的超过 81%的典型 HCMV 蛋白。

QTV 技术能够深入分析细胞表面的蛋白,绝大多数药物以细胞表面的蛋白为靶标。因 此说该团队不仅鉴定了 CMV 的入侵途径,还发现了许多新的治疗靶点。他们发现有 29 个 病毒蛋白位于细胞表面,其中 23 个是新发现的。这些蛋白能通过不同的方式影响先天免疫 和适应性免疫,一边躲避宿主免疫系统的救兵,一边瓦解细胞本身的防御力。