代谢组学( Metabonomics/ Metabolomics)是通过考察生物体系(细胞、组织或生物体)受刺激或扰动后(如将某个特定的基因变异或环境变化后)，其代谢产物的变化或其随时间的变化，来研究生物体系的一门科学。代谢组学通过揭示内在和外在因素影响下代谢整体的变化轨迹来反映某种病理生理过程中所发生的一系列生物事件。基因组学和蛋白组学告诉你可能发生什么，而代谢组学则告诉你已经发生了什么。
        代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物（分子量<1000）。其样品主要是血浆或血清，尿液，唾液，以及细胞和组织的提取液。