技术原理
在蛋白质组学中广泛采用的HPLC-MS/MS技术中,多肽的质谱分析次数与其丰度具有相关性,包括:蛋白的肽段序列覆盖率(sequence coverage)、肽段匹配数 (peptide hits)、PMSS 模型(peptide match score summation)、emPAI(exponentially modified PAI)等参数模型。
结合定量蛋白组学的非标定量(Label Free)策略及泛素化修饰motif的高灵敏度富集方法,我们可以在单次实验中定量到3000个以上泛素化修饰位点。为从大规模的样本中筛选药物靶点提供了技术基础。
技术优势
不使用任何标记试剂,样品处理简单
可同时比较大量样本之间的泛素化组差异信息
实验流程
参考文献
[1] LA Kane, L Michael, AI Fogel, et al. PINK1 phosphorylates ubiquitin to activate Parkin E3 ubiquitin ligase activity.. J Cell Biol. 2014, 205(2):143-153
[2] G Xu, JS Paige, SR Jaffrey, et al. Global Analysis of Lysine Ubiquitination by Ubiquitin Remnant Immunoaffinity Profiling. Nat Biotechnol. 2010, 28(8):868-873
[3] NM Griffin, J Yu, F Long, et al. Label-free, normalized quantification of complex mass spectrometry data for proteomic analysis. Nat Biotechnol 2010, 28(1):83-89